起诉书指控，被告人崔振吉在担任吉林市经贸委副主任，吉林市招商局局长，龙潭区委书记、区长，吉林市副市长，吉林市政协主席期间，利用职务上的便利为他人谋取利益，多次索取或者非法收受他人财物，数额特别巨大；并与他人相勾结，非法获得国家征收补偿款，数额特别巨大；作为国家机关工作人员，徇私舞弊滥用职权，致使国家利益遭受重大损失，情节特别严重，且充当黑恶势力“保护伞”，造成恶劣社会影响；被告人实际控制的吉林市某制药有限责任公司实施虚假破产行为，严重损害债权人利益，故应以受贿罪、贪污罪、滥用职权罪、虚假破产罪追究其刑事责任。